PCR 实验室即基因扩增实验室，因为实验过程存在核酸气溶胶污染风险，对洁净布局与气流控制要求很高，布局不合理会直接导致实验假阳性，影响检测结果准确性。很多单位建设 PCR 实验室，照搬普通实验室布局，结果频繁出现污染问题。
PCR 实验室核心原则是 “分区独立、单向流程、负压控制”，标准配置分为试剂准备区、标本制备区、扩增区、产物分析区四个独立区域，每个区域设置独立的缓冲间，实验流程单向推进，不能逆向往返。
每个实验区维持相对负压，空气从外向内流动，防止核酸气溶胶向外扩散。每个区域配备独立的通风与空调系统，不能共用回风，避免交叉污染。传递窗用于物品传递，采用双门互锁结构，开门时保证气流不互通。
围护材料选用光滑、耐腐蚀、无缝隙的净化板材，地面无缝整体处理，减少核酸颗粒吸附与藏匿。实验区内尽量减少突出物与死角，便于清洁消毒。
PCR 实验室属于高污染风险的洁净实验室，建设必须严格遵循行业规范，完工后需要做气流、压差、洁净度检测，验证布局合理性。投入使用后，也要建立严格的清洁消毒制度，避免累积污染。
